馬峙英長期致力于農業科技創新研究和生產服務，帶領團隊攻克抗病與豐產同步改良難題，育成了系列棉花“抗病高產”新品種，為解決棉花黃萎病重大生產問題提供了核心技術；突破優質高產多抗協同提高技術瓶頸，育成了系列棉花“優質高產”新品種，為棉花生產提質增效提供了支撐；突破光熱水資源不足和農機農藝不配套難題，創建了海河平原不同生態區小麥玉米節水豐產高效技術體系，為解決糧作生產用水多、產量低的問題提供了技術；解碼了陸地棉纖維品質和產量遺傳秘密；破譯了棉花育種改良的基因組結構變異及遺傳效應，發現了控制不同性狀的重要遺傳位點和新基因，為作物多性狀協同改良提供了新的理論依據和基因資源。